絶滅のおそれのある
日本の野生動物

日本（西表島）固有種または固有亜種。 西表島は面積が290平方kmほどで、これはヤマネコの住む島としては（またヤマネコの生息域としても）世界最小である。
分布域内では、主に標高200メートル以下にあるスダジイやカシからなる亜熱帯もしくは暖帯の森林に生息する。河川の周辺や低湿原、林縁などを好む。
イリオモテヤマネコの発見は1965年の戸川幸夫、記載は1967年に当時の国立科学博物館動物部長であった今泉吉典による。
西表島に野生ネコがいることは、以前から現地では知られており「ヤママヤ」（山にいるネコ）、「ヤマピカリャー」（山で光るもの）、「メーピスカリャー」（目がぴかっと光るもの）などと呼称し、野良猫を「ピンギマヤ」、飼い猫を単に「マヤ」やあるいは「マヤグヮー」と呼称し、区別していた。一方で、飼い猫が野生化した野猫ではないかとも考えられていた。また、沖縄がアメリカの占領下にあった頃に、アメリカの大学による総合調査が行われたが、その時もイリオモテヤマネコの発見には至らなかった。
1965年5月5日に、島南部の南風見田の浜にある、通称“マーレー”と呼ばれる小さな滝の下で、遠足にきていた大原中学校の生徒がけがをして弱っているオスを発見し、引率の教諭が捕獲した。別の教諭がこの個体の皮をホルマリン標本に、頭骨や骨格を木箱に入れ学校の裏に埋め、後に掘り起こされ、この個体がイリオモテヤマネコのタイプ標本となった。

1966年12月に仲間川中流域で猟師により、オスの成獣が生け捕られたが、これは直後に逃げられた。しかし、そのすぐ後に別のオスを捕獲した。同年1月15日には、仲間山付近でメスの若い個体が捕獲された。
その後、1967年5月に発行された哺乳類動物学雑誌の第3号・第4号でネコ科内でも原始的な分類群であるメタイルルス属Metailurusに近縁な新属新種として英文で発表された。和名は、イリオモテヤマネコと名付けられた。

体長は約76センチメートル、翼開長は約130センチメートル。朱色の皮膚が露出している顔、トキ亜科特有の下方に湾曲したくちばし（黒色。ただし先端は赤い）、後頭部にあるやや長めの冠羽が特徴である。全身は白っぽいが、春から夏にかけての繁殖期には首すじから黒い分泌物が出て、これを体に塗り付けるため頭から背のあたりが灰黒色になる。水浴びなどの後にその擦り付けを行うため、水浴び直後は特に濃く、ほとんど黒に近い。翼の下面は朱色がかった濃いピンク色をしており、日本ではこれを「とき色」（朱鷺色）という。脚も頭と同様に朱色で、虹彩は橙色。幼鳥は全身灰色で、頭部が黄色である。
19世紀までは東アジアに広く分布しており珍しくない鳥であったが、20世紀前半には激減した。
その後、昭和に入って1930年（昭和5年）から1932年（昭和7年）にかけて佐渡島で目撃例が報告され、1932年（昭和7年）5月には加茂村（→両津市、現佐渡市）の和木集落で、翌1933年（昭和8年）には新穂村（現佐渡市）の新穂山で営巣が確認されたことから、1934年（昭和9年）に天然記念物に指定された。当時はまだ佐渡島全域に生息しており、生息数は100羽前後と推定されていたが、その後、徐々に数を減らしていった。
1981年（昭和56年）1月11日から1月23日にかけて、佐渡島に残された最後の野生のトキ5羽すべてが捕獲され、佐渡トキ保護センターにおいて、人工飼育下に移された。（センターで付けられた足輪の色から『アカ』『シロ』『ミドリ』『キイロ』『アオ』と命名される）その後、繁殖の試みが続けられたが全て失敗し、2003年（平成15年）10月10日朝、最後の日本産トキ（キン）の死亡が確認され、日本産のトキは全て死亡した。ただし、生物学的にはまったく同一種である中国産のトキを用いて人工繁殖を行っているため、日本におけるトキの扱いは「絶滅」ではなく「野生絶滅」のままである。中国産や日本産という呼称は、人間の都合によるものでしかなく、両者の差異は個体間程度のものにとどまる。また、昭和初期の佐渡島や韓国には、現在日本で繁殖・放鳥が進められている「中国産」トキと同じ、ミトコンドリアDNAのハプロタイプがタイプ2にあたる個体がいたことも判明しており、日本と大陸の間でも遺伝的交流があったとみられる。

日本固有種の小型淡水魚で関東地方の一部に生息する。
明治時代後半、東京市小石川（現東京都文京区）の東京帝国大学付属植物園の池で発見された。このことが「ミヤコ」の和名由来と言われる。昭和初期には井の頭池及び神田川水系にも生息していた。
全長約6センチメートル。一対の口ひげがあり、産卵期に現れるオスの美しい婚姻色で知られる。
湧水を水源とした細流やため池に生息し、本種の生息地の下流域はヤリタナゴの生息河川である(あった)ケースが多い。天然分布域が東京近郊に偏在しているため、戦後の高度成長期を中心とした都市化で生息環境が次々に破壊され個体数が激減、絶滅に瀕している。

1974年に天然記念物に、1994年に国内希少野生動植物種に指定。環境省レッドリストでは、絶滅危惧IA類に当初から指定されている。したがって、許可のない捕獲採集や飼育、譲渡売買は禁じられている。ほとんどの生息地において地域社会が本種の保全に関心を持ち、生息地によっては密漁行為を監視、警察への通報を緊密に行なうなどしている。なお、近年では新規に生息地が発見されても密漁等を防ぐ意味で公開しないのが原則であるが、同時に保護が地域社会に浸透できず、どこからか密漁者もやってくるという悪循環に悩まされている。また、本種は湧水に続く小水路と水田耕作地という二次自然に強く依存しており、産卵母貝であるマツカサガイの維持には定期的な水路の土揚げや農業用溜池の池乾しなど手入れが欠かせず、それを周知できなかった過去においては保護がうまくいかなかったという苦い経験がある。すなわち本種の生態は、人間による耕作生産活動と密接不可分な関係にあり、人手不足や後継者難による耕作放棄など農村社会の荒廃が、本種の将来に暗い影を落としている。

また、本種生息地でのゴルフ場開発や圃場整備事業、河川のコンクリート護岸化や直線化などの生息地破壊につながる開発許可や公共事業は、本種の希少性が世に広く知られるようになった近年でも後を絶たない。